「國家磐石獎」由具專業素養和代表性之學者專家,政府首長及工商企業領袖進行多次評審，共同評選而出。

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磐石標章-追求卓越之生生不息 永續經營之企圖 
代表企業人追求成長及追求卓越之生生不息、永續經營之企圖。
中間三條直線代表產、官、學三方面的互相配合，提供中小企業從政府資源的運用、產業趨勢的分析與企業間的合作競爭，到經營診斷與績效提升之各項資源。同時亦是中小企業與經濟部中小企業處、中華民國全國中小企業總會三方面的緊密結合。
整體標誌中亦含有中華民國之「中」字及磐石獎之「石」字的抽象形於其中。